Francisco Marto urodził się 11 czerwca 1908, jako szóste z siedmiorga dzieci, w tej samej małej miejscowości, co jego kuzynka Łucja, w  Aljustrel.

Francisco był miłym i delikatnym chłopcem, który kochał zabawę i inne dzieci. Był odważnym rozjemcą, a jego zachowanie w trakcie ciężkiego przesłuchania przez administratora Ourem  później to pokazało. Potrafił być również bardzo złośliwy. Miał zamiłowanie do przyrody, a zwierząt w szczególności..

Raz dał grosik, a były to jego wszystkie pieniądze, znajomemu za złapanego ptaszka po to, aby tylko ptaka uwolnić. Przygrywał na fujarce z trzciny, a Łucja i jego siostra Hiacynta śpiewały i tańczyły.

Francisco początkowo nie brał udziału w pierwszym spotkaniu z Panią z nieba, dopóki nie spełnił jej prośby o modlitwę różańcową. Od tego czasu, mimo że widział Panią i czuł jej obecność, nigdy bezpośrednio nie słyszał jej słów, ani nie był w stanie werbalnie się z nią komunikować.

W trzecim objawieniu dzieciom powierzona została Tajemnica z wstrząsającymi wizjami, w tym jedną z piekła, które tak je zmieniły, że przypominały bardziej osoby dorosłe. Wtedy Administrator okręgu Arturo de Oliveira Santos, mason, wymyślił system zdyskredytowania objawień terroryzując dzieci. Próbował zmusić  je do kłamstwa, grożąc, że zostaną ugotowane w oleju, jeżeli nie wyjawią Tajemnicy.  Trzymał  je w więzieniu w czasie czwartego objawienia, 13 sierpnia po to, aby powstrzymać je od spotkania z Panią. Pojawiła się przed nimi kilka dni później.

Francisco poszedł do szkoły, ale wagarował tak często, jak tylko to było możliwe. Wolał spędzać czas modląc się do ukrytego w tabernakulum Jezusa. Jego wielką troską było pocieszyć frasobliwe serca Pana i Jego Matki.

Na pytanie, kim chciałby być, kiedy dorośnie, Francisco odpowiadał: “Nikim. Chcę umrzeć i pójść do nieba “.

W sierpniu 1918 roku, kiedy I wojna światowa zbliżała się do końca, Francisco zaraził się grypą. Zmarł rok później, spokojnie, 04 kwietnia 1919 roku, w wieku 11 lat.

Pochowano go następnego dnia w małym cmentarzem w Fatimie naprzeciwko kościoła parafialnego. Jego ciało zostało później przeniesione do Sanktuarium, które został zbudowane w miejscu objawień w Cova da Iria.